第一次被開除黨籍
1932年冬天,趙尚志率領的游擊隊在巴彥山區多次擊潰數倍於他們的日偽軍隊,由於趙尚志善於團結包括當地上層人物在內的一切抗日力量,所以他很憐惜把抗日根據地從巴彥擴大到齊齊哈爾附近的鎮來等地,抗日勢力迅速擴大。但是,當時執行王明極左路線的滿洲省委,卻認為趙尚志犯了『右傾錯誤』,並給予他撤銷參謀長職務的處分。盡管趙尚志失去了指揮游擊隊的權力,但他仍然在困境中堅持工作。不過由於這支剛剛組建的游擊隊群龍無首,加之新上任的參謀長執行著過左的路線,致使從前一批支持游擊隊的當地上層人物,紛紛投向日偽政權,因此北滿游擊隊腹背受敵。這時北滿的斗爭形勢逐漸惡化,入冬以後,日本關東軍又調集大批軍隊對北滿山區實施大規模搜山,使得北滿游擊隊多次受挫,死傷人數與日俱增。到了1933年1月,從前威震北滿的趙尚志游擊隊已經名存實亡。
1月中旬,趙尚志等突出重圍的游擊隊領導悄悄潛入敵偽統治的哈爾濱,准備向中共滿洲省委匯報游擊隊失敗的原因。不料當時主持工作的負責人,由於此前就對趙尚志懷有成見,因此在不了解游擊隊真正失敗原因的情況下,擅自作出一個《關於開除趙尚志黨籍的決議》。在這個決議中,省委把北滿游擊隊因對敵經驗不足最後導致失敗的責任,都歸結到趙尚志一人身上。
趙尚志雖然受到開除黨籍處分,但是,滿洲省委考慮到他的革命經歷與多年對敵斗爭的表現,大部分省委委員仍然主張讓趙尚志擔任群工工作,不久即任命他為工會主席。不過,趙尚志無意繼續留在省城哈爾濱,他的心仍然在盡快恢復和領導抗日武裝上。他知道只有盡快建一支游擊隊,纔能實現他抗擊日寇收復國土的夙願。
1935年省委恢復趙尚志黨籍
1933年4月,趙尚志來到賓縣孫朝陽的抗日聯軍裡任參謀長,不久他又投身珠河縣委領導下的抗日游擊隊,擔任縣中心大隊的隊長。一度受到不公正待遇的趙尚志,又在珠河一帶揮槍抗敵,他靈活機智的戰略戰術又讓接連吃敗仗的日偽軍聞之喪膽。
1934年5月,趙尚志率領的抗日聯軍繼攻陷敵偽統治的賓縣縣城之後,又接連攻克了五常和巴彥兩座縣城。在當年日本關東軍發起的冬季大掃蕩中,趙尚志領導的抗日武裝和齊齊哈爾的馬佔山部形成了一道堅不可摧的抗敵鎖鏈,致使關東軍發起的大討伐屢屢受挫,死傷無數。
鑒於趙尚志在對敵斗爭中的表現,中共滿洲省委在1935年1月12日,也就是趙尚志被開除黨籍的兩年之後,便正式作出《關於恢復趙尚志同志黨籍的決定》。
第二次被開除黨籍
1937年以來東北全境處於日偽的白色恐怖下,特別在面臨日軍對三江省(黑龍江合江地區)進行大規模冬季討伐,抗聯隊伍發生變化的時候,趙尚志也沒有絲毫氣餒。他在部隊打到彈盡糧絕以後,受北滿省委的派遣,越過黑龍江前往蘇聯設法尋求蘇聯的軍事援助。趙尚志做夢也沒有想到他來到蘇聯境內以後,由於蘇方的誤解竟會遭到扣押。1940年當趙尚志剛解除扣押,重新受命擔任東北抗日聯軍總司令,並准備率抗日聯軍與數倍於我的日軍進行血戰的時候,他沒有想到在蘇聯伯力竟忽然接到北滿省委關於永遠開除他黨籍的通知,這一決定讓愛黨至深的趙尚志簡直無法接受。
趙尚志在蘇聯看到這一文件後,悲憤欲絕,當場提筆給北滿省委寫了一封言詞誠懇的《請求書》。在承認自己確曾犯有錯誤的同時,趙尚志又聲淚俱下地要求北滿省委把他留在黨內。
北滿省委書記在收到趙尚志從蘇聯寄回的《請求書》後,不久即復信給趙尚志。他在復信中說:『北滿省委首先告訴尚志同志,北滿省委從來沒懷疑過尚志同志是奸細。也不是因此而開除黨籍的。更不是根據1938年以前的錯誤,而是根據1939年尚志同志在下江企圖策劃反黨的嚴重錯誤,而永遠開除的。在去年12月,xxx、xxx二同志來嶺西同我們見面時,我們纔知道尚志同志去年在下江行動的經過和反黨的企圖。……北滿省委根據上級黨的建議,尊重兄弟黨的建議,根據北滿黨大多數同志的討論決定,只取消「永遠」二字,改為「開除趙尚志黨籍」,其它,沒有減輕的餘地。……』
趙尚志在蘇聯收到省委主要負責人的信後纔清楚,所謂『根據上級黨的建議』和『尊重兄弟黨的建議』等語,都是無中生有,而輕信與他不和的xxx、xxx兩人的片面中傷,纔是北滿省委把他永遠開除出黨的根本原因。趙尚志雖然知道對自己黨籍的開除已鑄成新的冤案,然而在當時的政治情勢下,他遠在蘇聯既沒有申辯的機會,也得不到北滿省委的理解。於是他把巨大悲痛和委屈,都化作為自己繼續殺敵的動力。他知道早在1936年北滿臨時省委的會議上,他曾對王明、康生的指示信提出不同意見的時候,就已為自己在黨內的危機埋下了禍根。而他在領導抗聯和第三軍期間對當時北滿省委部分領導人的右傾錯誤所表現的不滿和非議,顯然是這次被永遠開除出黨的根源。
1942年2月12日,趙尚志在率領小股抗聯戰士對鶴立縣梧桐河警察署進行偷襲的時候,不料遭受到混入隊伍內的日偽特務的暗槍射擊,身受重傷,被俘八小時後壯烈殉國。趙尚志死後,日本關東軍大肆鼓噪,將他的頭顱由黑龍江空運至偽滿首都新京(長春),和在南滿犧牲的另一抗日名將楊靖宇的首級一起陳列。
趙尚志壯烈犧牲後,1947年,黑龍江省委在哈爾濱為他建碑紀念,並將他犧牲的鶴立縣更名為尚志縣。1982年,黨的十一屆三中全會後,中共黑龍江省委纔根據中央組織部的指示,對趙尚志同志1940年遭受黨內處分一事進行認真的復查。該年6月8日,黑龍江省委終於作出《關於恢復趙尚志同志黨籍的決定》。