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2001年三精制藥在哈藥集團內部率先實施二次改制轉為有限公司,並從此開始了低成本擴張,在當年收購黑龍江省明水縣藥廠,並在之後幾年陸續在省內低成本收購了黑河、孫吳、鶴崗等一批制藥企業,完成了生產布局的調整和建設。
2002年開始組建醫藥商業公司,並先後通過品牌嫁接的方式在國內設立了十幾個商業公司,形成了具有三精特色的營銷網絡。2003年為實現產品市場與資本市場的聯動,籌劃重組上市公司『天鵝股份』,並在2004年實現『借殼上市』,2005年完成了後序重組,置出水泥資產,換入藥業股權,實現了母子公司合並。2005年9月正式更名為哈藥集團三精制藥股份有限公司。目前公司主業清晰,資產質量優良,基本完成了普藥生產基地、中藥生產基地、保健品生產基地、兒童藥生產基地、原料藥生產基地的產業布局,並將陸續結束投入期,進入成長期,成為公司未來發展的堅實基礎和重要的經濟增長點。截止2006年5月,三精制藥已發展成擁有30個參股和控股子公司的大型集團式醫藥類上市公司,具備了利用資本市場功能整合其他藥業資源的條件和基礎,為進一步做大做強提供了新的保障。
2005年是公司完成重組上市後第一個完整的會計年度,公司主業盈利水平出現大幅提高。2005年度,公司實現主營業務收入17.69億元,同比增長175.24 %;主營業務利潤8.27億元,同比增長216.19%;利潤總額25,256萬元,同比增長566.51 %;淨利潤14,514萬元,同比增長443.70%。
2006年公司經營開局良好,一季度實現主營業務收入52,379萬元,主營業務利潤21,108萬元,淨利潤6,003萬元,分別同比增長9.15%、4.70%和185.3%。