單病種定額付費是指在確保醫療質量和醫療安全的基礎上，對單一病種病人從診斷、入院檢查、治療到康復出院實行醫療費用總額最高限定。其主要目的是控制新農合患者醫療費用的不合理增長，減輕參合農民就醫經濟負擔，保障新農合基金的合理、安全使用。這個縣開展的50種限額單病種主要包括腫瘤科、眼科、胸外科、小兒內科等16個科目。縣合管辦進行了精心測算，制定了50種疾病的限價標准，與定點醫療機構簽定了《單病種限額付費服務協議》，明確了定點醫療機構及醫務人員必須履行的義務，出臺了相應的處罰措施。